更敦群培于1905年生于西藏东北安多省热贡的双朋西村，俗名仁津南嘉。他的父亲阿拉嘉布是藏传佛教宁玛派（注1）的瑜伽居士，教他读、写、拼音、文法、诗和许多宁玛派的仪轨。父亲在他七岁的时候逝世，家产被贪婪的叔叔骗走。他被认证是一个宁玛派喇嘛阿勒吉札的转世。在安多，阿勒意指一个圣者的转世，即俗称的祖古，吉札则是指他前世的祖庙。十三岁时展现了才华，他创作了两首回文诗，诗的结构复杂，在一个矩形中从各个角度都可以朗读。他在热贡寺剃度出家，从上师处得到法名更敦群培。他在西宁外的贡布强巴林待了两年，透过西藏的辩经教学方法，他研习了格鲁传承的因明学和认识论。辩才无碍使他日渐成名，在一次重要学位的考试中，他力辩群雄，辩论的是寺中教科书，十七、八世纪间著名的修行者蒋扬谢巴的著作，他批驳了蒋扬的观点，所有强巴林的师生都被他辩得哑口无言。后来当更敦群培居住在中藏期间，蒋扬谢巴的转世来到拉萨的一座寺院参访，更敦群培担心蒋扬谢巴会因为他批驳其前世而沮丧，特地前去见他并献哈达以示敬重。这位蒋扬谢巴的转世却一点也不沮丧，当更敦群培进屋后，他立即起身相迎，直到更敦群培坐下后他才就座。