华南农业大学是国家重点农业类高校，是国家211工程高校，在全国高校综合排名中位居第87名；而安徽工程大学是安徽省内的一所以工科为主的省属高校；两所高校在办学性质和办学实力方面具有一定的差别。

华南农业大学位于广东省，繁荣发展的经济地域条件以及教育经费投入，使得华南农业大学在办学规模和办学实力方面占有独天得厚的优势，这些有利于高校发展的条件是安徽工程大学无法比拟的；而且华南农业大学办学历史悠久，历史发展时间长远，在社会上的影响力远远要比安徽工程大学要深远。

安徽省内高校高校数量相对比较少，仅仅有一所中国科技大学为国家985高校，合肥工业大学和安徽大学为国家211高校，而安徽工程大学在安徽省属高校中排名也比较靠后，其综合实力相对于其它几所省属高校具有一定的差别。

华南农业大学是全国重点大学，是国家211工程大学，是广东省和农业部共建高校。现阶段学校学科门类齐全，现有26个二级学院，共有95个本科专业，博士学位授权一级学科12个，博士专业学位类别1个，28个硕士学位授权一级学科，12个硕士专业学位类别，拥有61个博士学位授权点，有119个硕士学位授权点，博士后科研流动站11个；学校拥有农业昆虫与害虫防治、作物遗传育种、农业经济管理、果树学和预防兽医学等5个国家重点学科；24个省部级重点学科；农业科学、植物与动物学、化学、微生物学进入ESI全球前1%。

华南农业大学教育师资力量雄厚，教师师资力量配备结构合理，现有教职工3400人，各类高水平专业教育人才众多。有全日制在校生4.2万人，各类精品课程13个，其它优势专业、研究团队、科研中心结构合理，数量比较多。

安徽工程大学是一所以工科为主的多学科协调发展的省属高校。学校现有13个二级学院，70个本科专业，主要以本科、硕士研究生培养模式为主。学校拥有硕士学位授权一级学科12个，7个硕士学位授权类别，5个工程硕士学位类别。

安徽工程大学现拥有国家级、省级特色专业14个，国家省级综合改革试点专业15个；学校现有教职工1300余人，在校生2.2万余人。

华南农业大学和安徽工程大学两所高校在一起，无论在办学实力和水平方面，还是在办学规模以及科研师资力量配备方面都是有很大的差距的，安徽工程大学在这几方面是不具备优势的，而且安徽工程大学虽然为安徽省经济建设方面培养了大量的专业人才，但安徽省经济发展以及地域环境限制了其纵向发展。

虽然两高校的办学性质和发展不同，但华南农业大学优越的社会影响力和办学条件以及科研实力，安徽工程大学是无法比拟的，华南农业大学建校历史时间长，以被社会所完全认同，历年录取分数线也比较高。