为了满足21世纪所有中国人的粮食需求，农业部于1996年提出超级杂交水稻培育计划。其中一季杂交稻的产量指标是：第一期(1996—2000年)700公斤/亩；第二期(2001—2005年)800公斤/亩。

2000年，我国培育的超级杂交水稻品种达到了第一阶段单次水稻产量标准，即每公顷产量超过了10.5吨，一些品种已用于商业生产。　 被称为“杂交水稻之父”的中国工程院院士袁隆平介绍，2005年5月，他和同事们的努力集中在培育第二阶段的超级杂交水稻，并取得了良好的进展，其中最近开发出来的一些杂交水稻品种有每公顷13吨的潜力，最好的一个杂交水稻品种已连续两年都达到了每公顷12吨的水平。

科研人员已经取得了三个鼓舞人心的结果，即使用野生水稻中的优良基因、利用谷仓草中的DNA创造一个新的水稻来源、克隆玉米里相关基因并成功置入水稻里。正是基于这些技术进展，袁隆平等专家提出了第三阶段的超级杂交水稻计划的产量目标。 2005年5月，在江西南昌召开的杂交水稻产业化国际学术研讨会上，国家杂交水稻工程研究中心主任袁隆平称，根据目前的技术发展进度，由他主持的我国超级杂交水稻培育计划已提出了第三阶段的超级杂交水稻计划目标，将在2010年之前实现每公顷13.5吨的产量目标。

国家杂交水稻工程技术中心于2006年开始组建攻关研发团队，按照“良种、良法、良态”配套的原则，选育出了一批单产具900公斤潜力的超级杂交稻新组合。

从2010年开始，袁隆平院士领衔的专家团队联合长江大学、湖南省水稻所等单位，在湖南浏阳、醴陵、隆回等地广泛开展杂交水稻亩产900公斤攻关试验田。

2011年，中心组织在湖南省5个县实施攻关，5个百亩攻关片均获高产，其中隆回县羊古坳乡雷锋村百亩片平均亩产达926.6公斤。

2012年9月18日，由袁隆平研制的“Y两优2号”百亩超级杂交稻试验田正式进行收割、验收。农业部委派的专家组成员到场进行现场监督验收，并进行产量测定。专家组按照严格的测产验收规程，测得隆回县羊古坳乡雷峰村百亩片亩产达到926.6公斤。

2012年9月20日，溆浦县横板桥乡兴隆村的百亩片，种植品种组合Y2优8188，再度实现平均亩产超900公斤。专家组随机抽取了3块攻关田验收，经烘干去杂后，加权平均百亩片平均亩产917.72公斤。

2012年9月24日，国家杂交水稻工程技术中心表示，由袁隆平院士领衔的“超级杂交稻第三期亩产900公斤攻关”日前通过现场测产验收，以百亩片加权平均亩产917.72公斤的成绩突破攻关目标。袁隆平表示，连续两年百亩片平均亩产突破900公斤，标志着我国已成功实现该攻关目标。